En enero de 2008, y dentro del proceso de farmacovigilancia al que está sometida la vacuna del papilomavirus desde su implantación en la Unión Europea, la agencia comunitaria del medicamento (EMEA según sus siglas en inglés), informó del fallecimiento de dos mujeres, una en Austria y otra en Alemania, al poco tiempo de vacunarse con Gardasil. Sin embargo, no se pudo establecer una relación causal con la terapia y las autoridades insisten en que el beneficio del producto (prevenir la infección que puede causar cáncer en el cuello del útero), sigue siendo superior a sus posibles riesgos. En la UE, 1,5 millones de mujeres se han vacunado hasta la fecha.